Imazon及Instituto Socioambiental (ISA)的最新研究顯示，現時亞馬遜雨林近百分之四十四的土地雖然已劃為保護區，卻仍受非法侵占及不善管理所害。
這份葡萄牙语文件指出，截至二零一零年，巴西亞馬遜雨林的保護區面積達二日一十九萬七千四百八十五平方公里，其中約半(百份之五十點六)是國家公園等保育區，其餘百份之四十九點四則是土著的領域。
 截至二零一零年，巴西亞馬遜雨林的保護區面積比率 |
可是，報告同時指出，雖然受保護的地區面積龐大，其中不少區域卻有顯著的人為破壞。一九九八至二零零九年間，這些區域內有一萬二千二百零四平方公里的林木被砍伐。其中以規劃為「持續發展」的地區受到的破壞最為嚴重。
報告援引不善管理作保護區土地剝蝕的主因。巴西亞馬遜的保護區裹，近半缺乏經過批核的管理計劃，百分之四十五則沒有管理班子。一些地區人手嚴重不足— 例如帕拉州(Pará)每一千八百一十七平方公里的森林才有一個職員看守。
 截至2009年，巴西亞馬遜類計毀林面積與保護區狀況圖 |
報告認為保護區面對的危機包括非法砍伐及採礦。文中指出，該國批出了一千三百二十八個在保護地區中的開採申請，另外一百零三百四十八個申請正在處理中。
這份報告在巴西錄得毀林比率下降之際發表。該國自二零零四年每年的雨林開發比率已減少了百分之七十五。
二千年以降，巴西是世上最積極將土地納入保護的國家，十年間增加的保育地區面積裹，百分之六十位於巴西。但研究顯示，新增的保護區並不是毀林減少的主因。
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美國國家科學院 Proceedings of the National Academy of Sciences 二零一零年的公報指出 約百分之三十七被毀林的地區受惠於新增的保護區。巴西在二零零二年至二零零九年間， 推行亞馬遜保護區計劃( Amazon Region Protected Areas Program，ARPA)， 將亞馬遜雨林七十萬九千平方公里(二十七萬四千平方英里)、比美国得克萨斯州面積更大的地區納入保護區。
巴西亦推行了全國性的氣候改變應對計劃，訂下了進取的減少毀林目標。
引用: Veríssimo, A., Rolla, A., Vedoveto, M. & de Furtada, S.M. (2011) Áreas Protegidas na Amazônia Brasileira: avanços e desafios [PDF]. Imazon/ISA.